O mestrado conta com uma única área de concentração intitulada Território, Sociedade e Políticas Públicas, a mesma do eixo temático do curso, e que expressa a vocação inicial do curso que é focar nas inter-relações entre esses três grandes temas. Essa área de concentração foi concebida com o objetivo de articular conhecimentos oriundos de várias áreas das ciências humanas e sociais para analisar as múltiplas dinâmicas dos territórios e sua relação com as políticas públicas.

O programa ainda está articulado em torno de uma linha de pesquisa denominada Dinâmicas territoriais, ambientes e políticas públicas. Esta linha de pesquisa tem como objetivo pesquisar e desenvolver conhecimentos sobre as dinâmicas sociais, econômicas, ambientais, culturais e demográficas dos territórios e a construção de políticas públicas para esses territórios. Agrega estudos sobre contextos urbanos e rurais abrangendo temas como: segregação e desigualdades socioespaciais; conflitos e violência na cidade e no campo; etnicidade, alteridade e relações raciais; dinâmica populacional, espaço e gênero; comunidades e povos tradicionais; justiça socioespacial, socioambiental, agroecologia e modos de ocupação do espaço; Estado, dinâmicas de poder e políticas públicas; planejamento, gestão pública e políticas sociais; participação, movimentos sociais e socioambientais; justiça e direitos humanos; risco, desastres socioambientais e resiliência; geotecnologia, mapeamento participativo e cartografia social; educação e contextos locais.